我有两个孩子但户口本只记录了一个，能申请独

不能申请独生子女证，因为您已有两个孩子。从法律角度看，独生子女证是针对只有一个孩子的家庭，用于享受相关政策和待遇的证明。若您已生育两个孩子却申请独生子女证，将涉及虚假陈述，可能面临法律责任。若被相关部门发现并调查，问题就变得严重了，应及时咨询律师以避免法律风险。
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具体操作如下：1.如实申报：携带户口本、身份证等材料，前往户籍所在地的计划生育部门或相关部门，如实说明家庭情况，并放弃申请独生子女证。2.申请其他证明：若需证明一个孩子的情况（如教育、医疗等），可咨询相关部门，了解所需材料和流程，如出生证明、收养证明等，按照要求准备并申请。3.法律咨询：若对处理方式有疑问或担忧潜在法律风险，可咨询专业律师，获取针对个人情况的法律建议。
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处理方式分析：从法律角度，针对您的情况，常见的处理方式有两种：一是如实向相关部门申报您的家庭情况，放弃申请独生子女证；二是若因特殊原因需证明一个孩子的情况，可申请相关证明材料而非独生子女证。选择时，应考虑个人需求、法律合规性及潜在风险。